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速達丨LCMS-8060助力の広範な標的代謝グループ学の研究
日付:2022-05-12読み:0

mGWAS(metabolome Genome-Wide Association Study)は代謝グループ学に基づく全ゲノム関連解析を指し、代謝グループデータを表現型とし、遺伝子型データと関連解析する方法である。代謝グループデータは表現型同定に対してより精緻であるため、相関解析の精度は従来のGWAS解析よりも高い。

海南大学と華中農業大学のロジャー教授チームはmGWAS分野は建設が盛んで、近年では10編以上の関連研究が高得点雑誌に発表されている。

2020年12月7日、「Nature Plants」誌はオンラインで、イネ中のテルペン化合物の合成経路に関連する遺伝子クラスタを深解析したロジャー教授チームの新しい記事「Selection of a subspecies-specific diterpene gene cluster implicated in rice disease resistance」を発表した。ビステルペン類化合物はイネ中の植物抗生物質の主要な種類の1つであり、本研究では7番染色体(DGC 7)上に5,10−ビスケトンリシノール(単環リシノール誘導体のメンバー)の生物合成経路全体を完全にコードする遺伝子を発見したクラスター。

文章は代謝グループ検査技術を採用する――広範な標的代謝群の測定技術、高フラックス、高感度、広被覆、差異のない測定近を実現する1000種類の代謝物、助力代謝群学と多群学の研究。

イネ中のテルペン遺伝子クラスタの同定

本研究では、超高効率液体クロマトグラフィーを用いた三重四重極ロッド質量分析併用計LCMS-8060,対応する候補物を用いて侵襲または非侵襲のベンチュリタバコ葉に対して代謝スペクトル分析を行い、10−ケトンリシノールと5,10−ジケトンリシノール対照品を水稲葉から精製した。

5,10−ビスケトンリシノールの質量スペクトル図

aはベンズタバコ葉中のOsTPS 28、OsCYP 71 Z 2及びOsCYP 71 Z 21の同時過発現物である

bは5,10-ジケトンリシン標準品

本文で使用する直列質量分析計LCMS-8060とGCMS-TQ 8040(華中農業大学作物遺伝改良重点実験室で撮影)