1、イオン交換クロマトグラフィー、この分離方法は主にイオン交換の原理を応用し、低交換容量のイオン交換樹脂を用いてイオンを分離することであり、イオンクロマトグラフィー装置に広く応用されている方法でもある。その主なフィラータイプは有機イオン交換樹脂であり、スチレンジビニレンベンゼン共重合体を骨格とし、ベンゼン環にスルホン酸基を導入し、強酸型陽イオン交換樹脂を形成し、第三級アミン基を導入して第四級アミン型強アルカリ性陰イオン交換樹脂を形成する。この交換樹脂は大孔または薄殻型または多孔質表面層型の物理構造を有し、交換平衡に迅速に到達することを容易にし、イオン交換樹脂の耐酸塩基はいかなるpH範囲で使用でき、再生処理しやすい、使用寿命が長く、欠点は機械強度が悪く、膨潤しやすく、有機物に汚染されやすいことである。

2、イオン反発クロマトグラフィー、主にDonon膜反発効果に基づいて、イオン化成分は反発されて保持されないが、弱酸は一定の保持原理があり、イオン反発クロマトグラフィーを作成するのは主に有機酸とホウ酸根炭酸根と硫酸根有機酸などの無機酸素酸根の分離に用いられる。それは主に高交換容量のスルホン化H型陽イオン交換樹脂を充填剤とし、*をシャワー液として用いている。

3、イオン対クロマトグラフィー、イオン対クロマトグラフィーの固定相は疎水性の中性充填剤であり、スチレンジビニルベンゼン樹脂またはオクタデシルシリカゲル（ODS）を用いることができ、C 8シリカゲルまたはCNを用いることもでき、固定相流動相はいわゆる対イオン試薬と適量の有機溶媒を含む水溶液から構成され、対イオンはその電荷が測定すべきイオンとは反対であり、疎水性イオンを生成することができ、化合物の界面活性剤イオン、アニオン分離に用いる対イオンはテトラブチルアンモニウムヒドロキシド水酸化ヘキサデシル＊アルカンなどのアルキルアミン類、カチオン分離に用いる対イオンはアルキルスルホン酸類、アルカンスルホン酸ナトリウム、ヘプタンスルホン酸ナトリウム等のイオンに対する非極性端親脂肪極性端親水性、そのCH 2結合が長いほど化合物に対するイオンの固定相の保持が強くなり、極性流動相には、主に疎水性アニオンと金属錯体の分離に用いられ、その分離機構については3種類の異なる仮説、逆相イオンの分配イオン交換及びイオン相互作用がある。